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Ficha de información del producto
Título de la publicación / Nombre del producto :

Utilización de datos genómicos para reconstruir árboles de transmisión durante brotes infecciosos

Autor(es) : M.D. Hall, M.E.J. Woolhouse & A. Rambaut

Resumen :

Los datos de la secuencia genética de patógenos ofrecen un medio novedoso para investigar la propagación de enfermedades infecciosas entre individuos o establecimientos infectados, medio que viene a complementar la fórmula tradicional consistente en rastrear los contactos. De ahí que últimamente se haya dedicado un ingente trabajo a definir métodos útiles para ese fin. El objetivo radica en desentrañar el árbol de transmisión epidémica, que permite determinar quién infectó a quién. Los autores pasan revista a los diferentes planteamientos adoptados. El primer paso consiste en definir una medida de la diferencia entre secuencias, para lo cual hay que tener en cuenta factores como la recombinación o la convergencia evolutiva. Existen tres grandes clases de métodos, que presentan un grado creciente de complejidad: aquellos que presuponen que no hay diversidad genética ni mutaciones dentro del individuo infectado; aquellos que presuponen que no hay diversidad, pero admiten la posibilidad de mutaciones; y aquellos que postulan que ambas cosas pueden producirse. Hasta hace poco, en general se partía de la premisa de que era posible identificar a todos los individuos infectados en una epidemia.

Palabras clave
Análisis de secuencias – Árbol de transmisión – Epidemiología molecular – Filodinámica – Filogenética.

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