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Ficha de información del producto
Título de la publicación / Nombre del producto :

Herramientas de bioinformática para analizar datos de genómica vírica

Autor(es) : R.J. Orton, Q. Gu, J. Hughes, M. Maabar, S. Modha, S.B. Vattipally, G.S. Wilkie & A.J. Davison

Resumen :

El campo de la genómica vírica y la bioinformática conoce hoy un renovado dinamismo gracias a las técnicas de secuenciación de alto rendimiento, que permiten secuenciar con rapidez y rentabilidad, y a continuación ensamblar, un gran número de genomas víricos. Además, la potencia sin precedentes que ofrecen estas técnicas ha hecho posible analizar la diversidad vírica dentro de los anfitriones y la dinámica de cuasiespecies en relación con importantes interrogantes biológicos tocantes a la transmisión de virus, la resistencia a las vacunas o el salto de un anfitrión a otro. Con la secuenciación de alto rendimiento también es posible identificar con celeridad los virus tanto conocidos como eventualmente nuevos que estén presentes en muestras clínicas u obtenidas sobre el terreno, lo que aporta nuevas herramientas al arsenal disponible en los campos del descubrimiento de virus y la metagenómica. La bioinformática ha sido un factor capital en el auge de las aplicaciones de técnicas de secuenciación de alto rendimiento, pues continuamente se necesitan nuevos algoritmos y programas informáticos para procesar y analizar los vastos y complejos conjuntos de datos que se generan en un ámbito sujeto a tan rápida evolución.

Palabras clave

Asignación de variantes – Bioinformática – Cuasiespecies – Ensamblaje de novo – Metagenómica – Programas informáticos – Secuenciación de alto rendimiento – Secuenciación de próxima generación – Virus.

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