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Fiche extrait de produit
Titre du produit :

La génomique au service de la surveillance des agents infectieux vétérinaires

Auteur(s) : E. Mathijs, F. Vandenbussche & S. Van Borm

Résumé :

La mondialisation, le changement climatique et l’intensification de la production agricole sont des facteurs pouvant entraîner un risque accru d’émergence d’agents pathogènes infectieux. En conséquence, il est impératif de disposer d’outils de surveillance souples d’emploi au sein du laboratoire pour identifier, caractériser et contrôler rapidement les maladies émergentes et ré-émergentes au niveau mondial. Un grand nombre d’outils sont disponibles, mais ce sont les technologies de séquençage qui ont ouvert une nouvelle ère de la surveillance des agents pathogènes. Les auteurs passent en revue les différentes applications potentielles des technologies génomiques à haut débit dans le domaine de la surveillance des agents pathogènes vétérinaires. Ils examinent plus particulièrement les deux types de surveillance auxquels ces nouveaux outils vont le plus contribuer : la surveillance axée sur les dangers (identification et caractérisation des agents pathogènes) et la surveillance précoce en amont (découverte des agents pathogènes). Après avoir expliqué les perspectives d’amélioration des moyens diagnostiques en ayant recours à l’utilisation des données de séquençage, les auteurs soulignent les principales difficultés qui entravent l’utilisation systématique de cette technologie dans le domaine vétérinaire.

Mots-clés
Agent pathogène vétérinaire – Caractérisation – Génomique – Maladie infectieuse – Métagénomique – Séquençage à haut débit – Séquençage de nouvelle génération – Séquençage du génome entier – Surveillance.

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