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Fiche extrait de produit
Titre du produit :

Vers la validation et l’assurance qualité des flux de données de séquençage de nouvelle génération utilisés en biologie des maladies animales infectieuses

Auteur(s) : S. Van Borm, J. Wang, F. Granberg & A. Colling

Résumé :

Les avancées récentes enregistrées en matière de séquençage de l’ADN et d’analyse des données de séquences ont révolutionné la recherche dans de nombreux domaines de la biologie et de la médecine, notamment la biologie des maladies animales infectieuses. Ces nouvelles technologies vont permettre de combler le fossé qui séparait la recherche fondamentale du laboratoire de diagnostic. Après avoir défini l’intérêt diagnostique des applications du séquençage de nouvelle génération (SNG) ainsi que leurs finalités dans le domaine de la biologie des maladies animales infectieuses, les auteurs examinent leur compatibilité avec les méthodes et les principes actuels de validation recommandés par l’Organisation mondiale de la santé animale. Ils proposent quelques paramètres critiques de validation et de contrôle qualité (mesure de la qualité), en se référant aux lignes directrices de validation et d’assurance qualité des techniques diagnostiques basées sur le séquençage de nouvelle génération visant à détecter les maladies humaines héréditaires. Certes, la plupart des applications actuelles des méthodes de séquençage de nouvelle génération en biologie des maladies animales infectieuses ne constituent pas des tests de diagnostic primaire (dont dépendent directement les décisions de contrôle sanitaire) ; toutefois, l’analyse critique proposée par les auteurs sur les avantages de cette technologie et sur les difficultés restant à résoudre devrait ouvrir la voie à des discussions sur l’intérêt diagnostique des méthodes recourant au séquençage de nouvelle génération ainsi que sur les perspectives de validation et de contrôle de leurs performances diagnostiques.

Mots-clés

Assurance qualité – Méthodes de diagnostic moléculaire – Séquençage de nouvelle génération – Validation.

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