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Ficha de información del producto
Título de la publicación / Nombre del producto :

Categorías de referencia relativas al acabado de la secuenciación de alto rendimiento de genomas víricos

Autor(es) : J.T. Ladner, J.H. Kuhn & G. Palacios

Resumen :

La secuenciación del genoma vírico se ha erigido a día de hoy en la piedra angular de casi todos los aspectos de la virología. La secuenciación de alto rendimiento de próxima generación, en particular, es ahora un componente integral de las investigaciones de epidemiología molecular sobre brotes de enfermedades víricas como los registrados últimamente de síndrome respiratorio de Oriente Medio, enfermedad por el virus del Ebola o infección por el virus Zika. Numerosas instituciones se han dotado de las competencias técnicas y la infraestructura necesaria para llevar a cabo tales investigaciones, como deja patente la acumulación de miles de nuevas secuencias víricas en periodos de tiempo cada vez más cortos. En fechas recientes los autores han propuesto una nomenclatura compuesta de cinco categorías de referencia que sirven para describir la calidad de las secuencias de genoma vírico determinadas por secuenciación de alto rendimiento. Estas cinco categorías (borrador normal, gran calidad, codificación completa, completa y acabada) cubren toda la gradación de acabados en la secuenciación de genoma vírico y pueden ser aplicadas a las secuencias obtenidas por cualquier dispositivo técnico o cualquier técnica de ensamblaje.

Palabras clave
Elaboración de contramedidas médicas – Ensamblaje del genoma – Epidemiología molecular – Genómica de poblaciones – Mantenimiento y organización de datos – Secuenciación de alto rendimiento – Virus.

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