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Fiche extrait de produit
Titre du produit :

Protocole de séquençage de la VP1 pour les études d’épidémiologie moléculaire du virus de la fièvre aphteuse

Auteur(s) : N.J. Knowles, J. Wadsworth, K. Bachanek-Bankowska & D.P. King

Résumé :

Les séquences de nucléotides des souches de terrain du virus de la fièvre aphteuse nous aident à comprendre la distribution et l’évolution des lignées virales présentes dans les différentes régions du monde. Les auteurs décrivent les grandes lignes d’un protocole pratique, basé sur l’amplification en chaîne par polymérase couplée à une transcription inverse (RT-PCR) et sur le séquençage, qui peut être utilisé pour générer des séquences d’ARN codant pour la région VP1 (1D) du virus de la fièvre aphteuse. Le protocole permet de procéder à une sélection parmi un panel de PCR et de marqueurs de séquençage dans le but de caractériser les gènes de divers isolats représentant les sept sérotypes du virus de la fièvre aphteuse. Les auteurs décrivent également une liste de séquences pouvant servir de cadre à l’analyse phylogénétique, dont des séquences prototypes pour tous les topotypes proposés du virus de la fièvre aphteuse. Les données techniques détaillées et les séquences prototypes fournies par les auteurs peuvent être utilisées par les Laboratoires de référence pour la fièvre aphteuse et d’autres institutions, en vue d’harmoniser l’épidémiologie moléculaire du virus de la fièvre aphteuse.

Mots-clés
Amplification en chaîne par polymérase couplée à une transcription inverse – Phylogénétique – Prototype – Référence – Séquençage – Séquence – Virus de la fièvre aphteuse.

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